Эволюционное древо пресмыкающихся показывает, как мало видов выжило со времен их расцвета. Крокодилы и аллигаторы являются ближайшими ныне живущими родственниками динозавров, а также имеют наиболее развитые сердце (смотри рисунки: Сердце; ) и мозг (смотри рисунки: Мозг; ) Морские, сухопутные и пресноводные черепахи очень мало изменились за миллионы лет; как и многие другие области эволюции пресмыкающихся, их происхождение остается неясным. Терапсиды, хотя все их виды сейчас являются вымершими, являются существенной эволюционной ветвью, так как от них произошли синалтозавры, от которых, в свою очередь, произошли млекопитающие (смотри рисунки: Млекопитающие часть 1; Млекопитающие часть 2; Млекопитающие часть 3; Млекопитающие часть 4; Млекопитающие часть 5; ) Все они, однако, эволюционировали от самой ранней группы пресмыкающихся, котилозавров.